Salmonella en milieu hospitalier au Niger : sérotypes et gènes de résistance isolés au laboratoire de biologie de l’hôpital National de Niamey

Résumé

Introduction : Salmonella spp. est une entérobactérie impliquée dans les gastroentérites et la fièvre typhoïde. Elle constitue une préoccupation majeure de santé publique en raison de son potentiel épidémique et de l’émergence croissante de souches résistantes aux antibiotiques. L’objectif de cette étude était de caractériser le profil sérotypique et les gènes de résistance des isolats de Salmonella identifiés au laboratoire de biologie médicale de l’Hôpital National de Niamey. Méthodologie : L’isolement des souches a été réalisé sur milieu Hektoen, l’identification des espèces par galerie API 20E, et l’antibiogramme par la méthode de diffusion de disques  sur gélose Muller Hinton (MH)  selon les directives de l’EUCAST, pour la ciprofloxacine et la lévofloxacine l’E-test a été utilisé. Les souches ont ensuite été conservées par congélation puis envoyées à l’Institut Pasteur de Dakar pour le sérotypage et la recherche de gènes de résistance. Résultats : au total, 39 souches de Salmonella ont été isolées parmi 1405 cultures positives, correspondant à une prévalence de 2,8 %. La majorité des cas concernait des enfants de moins de 6 ans. Une douzaine de sérovars ont été identifiés, avec une prédominance du sérovar Enteritidis. Une seule souche du sérovar Typhi a été détectée. Dans l’ensemble, les isolats présentaient une faible résistance aux antibiotiques testés. Toutefois, 11,11 % des souches exprimaient un phénotype BLSE. Les principaux gènes de résistance identifiés étaient blaCTX-M-15, blaOXA-1, TEM-1, qnrB, et aac(6')-Ib-cr. Conclusion : Le phénomène de résistance aux antibiotiques, notamment aux fluoroquinolones, est clairement perceptible dans les souches analysées