Performances diagnostiques du test GenoType® MTBDRsl V2 dans la détection de la tuberculose ultra-résistante chez les patients avec ou sans co-infection par le VIH à Bamako, Mali

Résumé

Introduction : le diagnostic rapide de la tuberculose résistante à la rifampicine (TB-RR) ou multirésistante (TB
MR), associé au traitement antituberculeux de 2ème ligne reste un élément important dans la lutte contre la
tuberculose pharmaco-résistante (TB-PR). L’objectif de ce travail était d’évaluer la performance diagnostique du
test GenoType® MTBDRsl VER 2.0 dans la détection de la TB-PR à Bamako, Mali à partir de l’ADN récupéré de
la cartouche Xpert® MTB/RIF par rapport à la méthode de référence. Méthodologie : nous avons réalisé une
étude transversale chez les patients suspects de la TB-RR/MR entre février 2019 et mars 2025 dans le laboratoire
P-3 de Mycobactériologie et des Fièvres Hémorragiques du Centre Universitaire de Recherche Clinique (UCRC).
Après confirmation de la TB-RR par le test Xpert® MTB/RIF, l’ADN du Complexe Mycobacterium tuberculosis
(CMT) extrait a été récupéré directement à partir des cartouches pour la réalisation du test GenoType® MTBDRsl
VER 2.0. La méthode de susceptibilité phénotypique 2ème ligne de BD/BACTEC/MGIT a été utilisée comme test
de référence. Résultats : vingt-huit (28) cartouches de 28 patients différents ont été utilisées. Le sex-ratio des
patients était de 2,5 et la co-infection TB/VIH était de 35,71%. Les fréquences de la TB-Pré-ultrarésistante (Pre
UR) et TB-UR ont été respectivement de 3/28 et 1/28. La sensibilité, la spécificité, les valeurs prédictives positive
et négative du test GenoType® MTBDRsl VER 2.0 ont été respectivement de 100%, 87,50%, 100% et 57,14%.
Les mutations ont été observées au niveau des gènes gyrA pour les fluoroquinolones et rrs pour les
aminoglycosides. Conclusion : plus rapide et facile à réaliser, le test GenoType® MTBDRsl VER 2.0 a montré
une bonne performance dans la détection des résistances aux fluoroquinolones que les aminoglycosides. Un
échantillonnage beaucoup plus large est nécessaire pour confirmer ces tendances afin de vite détecter la circulation
des souches de TB-PR.